Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD1P0DJD0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms