Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4AP0C0L4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4AP0C0L4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms