Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTBP09497 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTBP09497 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTBP09497 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTBP09497 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTBP09497 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTBP09497 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTBP09497 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTBP09497 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTBP09497 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTBP09497 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTBP09497 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTBP09497 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTBP09497 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTBP09497 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTBP09497 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTBP09497 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTBP09497 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTBP09497 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTBP09497 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTBP09497 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTBP09497 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTBP09497 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTBP09497 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTBP09497 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTBP09497 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTBP09497 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms