Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
A1BGP04217 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A1BGP04217 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A1BGP04217 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A1BGP04217 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A1BGP04217 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A1BGP04217 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A1BGP04217 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A1BGP04217 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A1BGP04217 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A1BGP04217 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A1BGP04217 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A1BGP04217 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
A1BGP04217 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A1BGP04217 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
A1BGP04217 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A1BGP04217 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A1BGP04217 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A1BGP04217 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
A1BGP04217 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A1BGP04217 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A1BGP04217 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A1BGP04217 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A1BGP04217 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A1BGP04217 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A1BGP04217 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A1BGP04217 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A1BGP04217 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A1BGP04217 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A1BGP04217 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
A1BGP04217 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A1BGP04217 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A1BGP04217 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
A1BGP04217 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A1BGP04217 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A1BGP04217 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A1BGP04217 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A1BGP04217 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A1BGP04217 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A1BGP04217 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
A1BGP04217 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A1BGP04217 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A1BGP04217 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
A1BGP04217 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
A1BGP04217 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A1BGP04217 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A1BGP04217 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
A1BGP04217 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A1BGP04217 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A1BGP04217 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A1BGP04217 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A1BGP04217 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A1BGP04217 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A1BGP04217 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
A1BGP04217 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
A1BGP04217 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A1BGP04217 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A1BGP04217 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A1BGP04217 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
A1BGP04217 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A1BGP04217 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A1BGP04217 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A1BGP04217 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A1BGP04217 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A1BGP04217 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
A1BGP04217 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A1BGP04217 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A1BGP04217 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A1BGP04217 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A1BGP04217 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A1BGP04217 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A1BGP04217 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A1BGP04217 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A1BGP04217 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A1BGP04217 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A1BGP04217 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A1BGP04217 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A1BGP04217 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A1BGP04217 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A1BGP04217 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A1BGP04217 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A1BGP04217 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A1BGP04217 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A1BGP04217 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms