Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLR1AO95602 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 289.7 ms