Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF4AO95239 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms