Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOX1O75936 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms