Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP9O75884 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms