Protein–RNA interactions for Protein: O75554

WBP4, WW domain-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WBP4O75554 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WBP4O75554 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WBP4O75554 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WBP4O75554 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WBP4O75554 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WBP4O75554 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WBP4O75554 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WBP4O75554 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WBP4O75554 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
WBP4O75554 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WBP4O75554 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WBP4O75554 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WBP4O75554 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WBP4O75554 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WBP4O75554 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WBP4O75554 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WBP4O75554 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WBP4O75554 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WBP4O75554 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WBP4O75554 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms