Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR5O75473 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR5O75473 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR5O75473 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR5O75473 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR5O75473 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR5O75473 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LGR5O75473 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LGR5O75473 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LGR5O75473 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR5O75473 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR5O75473 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR5O75473 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR5O75473 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR5O75473 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR5O75473 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR5O75473 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR5O75473 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR5O75473 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR5O75473 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR5O75473 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR5O75473 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR5O75473 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR5O75473 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR5O75473 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR5O75473 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR5O75473 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR5O75473 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR5O75473 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR5O75473 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR5O75473 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR5O75473 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR5O75473 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR5O75473 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR5O75473 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR5O75473 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR5O75473 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms