Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX3O75364 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX3O75364 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX3O75364 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX3O75364 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX3O75364 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX3O75364 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX3O75364 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX3O75364 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX3O75364 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX3O75364 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX3O75364 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX3O75364 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX3O75364 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX3O75364 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX3O75364 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX3O75364 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX3O75364 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX3O75364 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX3O75364 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX3O75364 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms