Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP2O75323 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIPSNAP2O75323 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms