Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms