Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBNO60934 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBNO60934 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBNO60934 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBNO60934 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NBNO60934 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBNO60934 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBNO60934 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBNO60934 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NBNO60934 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NBNO60934 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBNO60934 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBNO60934 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBNO60934 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NBNO60934 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBNO60934 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBNO60934 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBNO60934 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBNO60934 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NBNO60934 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NBNO60934 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NBNO60934 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NBNO60934 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NBNO60934 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NBNO60934 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NBNO60934 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NBNO60934 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NBNO60934 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NBNO60934 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NBNO60934 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NBNO60934 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NBNO60934 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NBNO60934 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NBNO60934 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NBNO60934 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NBNO60934 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms