Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND1O60716 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms