Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX16O60231 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX16O60231 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX16O60231 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX16O60231 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX16O60231 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX16O60231 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DHX16O60231 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DHX16O60231 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DHX16O60231 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DHX16O60231 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DHX16O60231 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DHX16O60231 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX16O60231 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX16O60231 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX16O60231 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX16O60231 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX16O60231 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX16O60231 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX16O60231 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX16O60231 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX16O60231 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX16O60231 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX16O60231 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX16O60231 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX16O60231 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX16O60231 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX16O60231 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX16O60231 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX16O60231 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX16O60231 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX16O60231 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX16O60231 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX16O60231 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX16O60231 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX16O60231 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX16O60231 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX16O60231 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX16O60231 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX16O60231 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX16O60231 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX16O60231 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX16O60231 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX16O60231 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms