Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDIL3O43854 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms