Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRC1O43663 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRC1O43663 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRC1O43663 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRC1O43663 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRC1O43663 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRC1O43663 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRC1O43663 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRC1O43663 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRC1O43663 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRC1O43663 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRC1O43663 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRC1O43663 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRC1O43663 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRC1O43663 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRC1O43663 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRC1O43663 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRC1O43663 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRC1O43663 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRC1O43663 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRC1O43663 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRC1O43663 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRC1O43663 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRC1O43663 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRC1O43663 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRC1O43663 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRC1O43663 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRC1O43663 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms