Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP3O43295 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms