Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DYNC1LI2O43237 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI2O43237 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms