Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF113AO15541 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF113AO15541 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms