Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms