Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
O00370 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
O00370 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
O00370 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
O00370 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
O00370 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
O00370 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
O00370 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
O00370 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
O00370 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
O00370 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
O00370 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
O00370 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
O00370 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
O00370 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
O00370 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
O00370 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
O00370 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
O00370 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
O00370 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
O00370 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
O00370 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
O00370 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
O00370 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
O00370 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
O00370 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
O00370 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
O00370 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
O00370 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
O00370 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
O00370 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms