Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms