Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E9PMD0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PMD0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PMD0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PMD0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PMD0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PMD0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PMD0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PMD0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PMD0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PMD0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PMD0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PMD0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PMD0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PMD0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PMD0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PMD0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E9PMD0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E9PMD0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E9PMD0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E9PMD0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E9PMD0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
E9PMD0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E9PMD0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E9PMD0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E9PMD0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E9PMD0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E9PMD0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms