Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-2B6SEH9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms