Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms