Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms