Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6BA6NDN3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6BA6NDN3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6BA6NDN3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6BA6NDN3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6BA6NDN3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6BA6NDN3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6BA6NDN3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6BA6NDN3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6BA6NDN3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6BA6NDN3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms