Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms