Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms