Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms