Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms