Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ALG13-225ENST00000621367 3893 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ZNF197-205ENST00000396058 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ATP6V1C1-201ENST00000395862 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 DNAJC27-AS1-205ENST00000434897 4660 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MYH2-202ENST00000397183 6078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PTPRB-204ENST00000538708 5839 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ANKS1B-215ENST00000549493 3328 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 TMCC1-201ENST00000393238 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 XRCC6P2-201ENST00000457831 1822 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 SEMA4D-202ENST00000356444 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MASP1-205ENST00000392472 3900 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 TNC-210ENST00000535648 7508 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 HCG18-240ENST00000454269 2430 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CCDC149-204ENST00000504487 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 WDR11-201ENST00000263461 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 BRD7P2-201ENST00000466133 1944 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 OTX2-201ENST00000339475 3001 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ZNF385D-AS2-202ENST00000448980 370 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 LINC02418-202ENST00000567788 4592 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 SYNJ1-211ENST00000630077 6898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ZNF345-206ENST00000529555 3527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 GSN-AS1-201ENST00000414544 4763 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC006269.1-201ENST00000636752 2789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 UGT2B7-205ENST00000622664 1532 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MET-202ENST00000397752 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 LCT-201ENST00000264162 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 FANCM-202ENST00000542564 6167 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 SYNPR-208ENST00000472899 527 ntTSL 4 BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms