Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 IGKV1OR1-1-201ENST00000613775 347 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 CFAP61-210ENST00000451767 1946 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 PFKFB1-203ENST00000545676 1591 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 SMAD5-AS1-201ENST00000297163 1816 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 IFNA7-201ENST00000239347 737 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 SP140-202ENST00000373645 814 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AL606752.1-201ENST00000435442 666 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AL137027.1-201ENST00000440358 444 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 CASK-AS1-201ENST00000451126 515 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AC018816.1-206ENST00000474544 455 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AC006387.1-203ENST00000494849 342 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 LEMD1-208ENST00000495594 637 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AC009269.1-203ENST00000496414 828 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AC146944.2-201ENST00000504546 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AC139495.1-201ENST00000510264 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 MIR4642-201ENST00000583943 82 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 RN7SL664P-201ENST00000584239 305 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AL137190.1-201ENST00000603288 282 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AC244196.3-201ENST00000614171 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 CRYAB-216ENST00000616970 977 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 ZNF655-222ENST00000493277 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 METTL18-202ENST00000310392 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 ANKS1B-201ENST00000329257 996 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 RNU1-21P-201ENST00000363327 163 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 MSRB1P1-201ENST00000396851 354 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AC064874.1-201ENST00000409661 441 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AC004986.1-201ENST00000414855 607 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 CRIP1P3-201ENST00000416794 220 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AC007422.2-201ENST00000419809 167 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AL137220.1-201ENST00000431369 661 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 PYHIN5P-201ENST00000431627 723 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 BX322234.2-202ENST00000435612 479 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 AL450384.2-202ENST00000436485 656 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FAM58BPP0C7Q3 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms