Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SETBP1Q9Y6X0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETBP1Q9Y6X0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms