Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AUP1Q9Y679 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms