Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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SH3BP1Q9Y3L3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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SH3BP1Q9Y3L3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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SH3BP1Q9Y3L3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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