Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NINLQ9Y2I6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NINLQ9Y2I6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms