Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOD1Q9Y239 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms