Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN3Q9UPQ7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms