Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN72

PCDHA7, Protocadherin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA7Q9UN72 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA7Q9UN72 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms