Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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USP18Q9UMW8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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USP18Q9UMW8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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USP18Q9UMW8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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USP18Q9UMW8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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USP18Q9UMW8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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USP18Q9UMW8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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USP18Q9UMW8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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USP18Q9UMW8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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USP18Q9UMW8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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USP18Q9UMW8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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