Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PACSIN3Q9UKS6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms