Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP4Q9UKK3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms