Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF2Q9UK05 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDF2Q9UK05 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms