Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms