Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYTH4Q9UIA0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTH4Q9UIA0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms