Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms