Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms